予後に影響を与える要因は多岐にわたり、個々の患者さんに合わせた経過観察が必要です。
経口避妊薬（ピル）の血中濃度を低下させることがあります。ペニシリン内服中では、ペニシリンが腸内細菌にも作用し、細菌叢（さいきんそう：腸内に存在している細菌）を変化させ卵黄ホルモンの腸管からの再吸収を抑制するために、卵黄ホルモンの血中濃度の低下があるため、ペニシリン服薬中の低用量経口避妊薬（ピル）の避妊は失敗する可能性があります。他の避妊方法を併用することが必要かも知れません。
耳鼻科でアモキシシリンとアセトアミノフェンが処方された2歳児。併用薬の投与量や服用回数、期間から、疑義照会するかどうか意見が分かれました。
※禁忌とは、重篤な副作用などのために、当該医薬品を使用してはいけない
※※薬の相互作用薬とは、副作用が出やすくなる、薬効が減弱することが考えられる薬などの飲み合わせ
フィリピンの土壌から1952年に発見され、ペニシリン、セフェム系とは異なった化学構造で、抗炎症作用、免疫調節作用など抗菌力以外の作用もあるため、慢性閉塞性肺疾患などにも使用されています。歯科ではクラリスロマイシン（商品名：クラリス他）アジスロマイシン（商品名：ジスロマック他）が処方されることが多いです。マクロライド系は、安全性は高いですが、クラリスロマイシンは肝臓のチトクロームで代謝されるため、同じ部位で代謝される薬剤は併用注意となるために、併用注意薬があります。薬局などでご確認ください。重篤なものは併用禁忌となっています。
薬の飲み合わせ（相互作用）も心配です。 抗菌薬は、細菌の増殖を抑えたり死滅 ..
薬剤の飲み合わせとしては、低用量経口避妊薬（ピル）と抗凝固薬のワーファリンに対する影響が挙げられますがいずれも影響は少ないので禁忌事項ではありません。
マクロライドアレルギーの患者さん
クラリスロマイシンの併用禁忌：自閉症などに用いられるピモジド（商品名：オーラップ）、片頭痛薬のエルゴタミン製剤（商品名：クリアミン、ジヒデルゴット）及び肺動脈性高血圧薬のタダラフィル（商品名：アドシルカ）に対してはピモジド、エルゴタミン製剤及びタダラフィルの血中濃度を上げるために禁忌です。肝臓、腎臓に障害があり、痛風及びベーチエット薬のコルヒチン服薬中の患者さんでは、コルヒチンの毒性増強のため併用禁忌です。
プラゾールナトリウム（25mg/kg/日）を 4 週間併用投与
全てのキノロン系は、増血薬の鉄剤（商品名：フェロミア他）及びアルミニウム含有の胃薬（商品名：マーロックス他）との併用によりキノロン系薬の血中濃度が低下し、キノロン系薬の効果の減弱が予想されます。
痛み止めとの併用により痙攣などの症状がみられることがあります。
痙攣などの症状が強く出る薬剤の組み合わせ（ロメフロキサシン塩酸塩とフルルビプロフェン（商品名：フロベン））は併用禁忌です。
ミノマイシン塩酸塩（商品名：ミノマイシン他）が経口薬として使用されている。歯科では歯周病治療薬として歯科用軟膏が多く使われています。